生物样本库BS小组
摘要
背景：人脑肿瘤患者活检样本中的核糖体RNA常发生降解，这导致这些样本不能用于转录组学相关实验。该问题尚未在既往以优化脑肿瘤分子分型的研究中得到较好的记载。
目的：评估大样本量队列中人脑肿瘤活检样本中RNA完整性，并且评估在小鼠恶性胶质瘤模型中及其它亚群患者活检样本中影响RNA完整性的因素。
方法：从各病种人脑肿瘤例活检样本中提取总RNA，并用生物分析仪处理。样本核糖体28S/18S峰值比率≥1.2或RNA完整指数（RIN值）≥6时认为RNA的完整性正常。在小鼠模型中评估了离体缺血的时间依赖效应，并在新收集的27例人活检样本中对其结果进行了验证。同时在32例活检中进一步进行了再分割获得多个样本。
结果：例人活检样本结果显示有较大比例的样本发生了RNA降解（27.5%）。小鼠模型结果证实了RNA降解与离体缺血时间存在相关性。人活检样本再分割后立即抽提会减少RNA的降解。结合活检样本取样后的速冻处理及多分装可以降低样本中RNA的降解，使其降解率减少为原来的一半（15.6%）。
结论：本研究是对人脑肿瘤活检样本中影响RNA降解因素的首次简要探索。肿瘤区域切除后的立即活检取样、速冻及样本多分装均可提高RNA的质量。
图1:文章补充资料-肿瘤样本采集、分装注意事项
作者：CastellsDomingoX,etal.
编译：王晔
校审：叶庆
原文：
ImprovingRibosomalRNAIntegrityinSurgicallyResectedHumanBrainTumorBiopsies.BiopreservBiobank.Apr;14(2):-64.doi:10./bio...EpubFeb17.